零餘額帳戶公司的各分支機構都在同一家銀行開戶，但每一戶頭平時都無盈餘，也就是零餘額，由於公司授權各分支機構可簽發支票，則當持票人請付款時，付款銀行首先將其分別記入該帳戶借方，等當日營業結束後，再將其轉入貸方，使帳面餘額維持為零，最後將當天付款總額借記在該資金集中管理帳戶內。通常當一個大企業機構採用分散付款時，採用零餘額帳戶可集中資金管理。
